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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
Data corrente: |
30/08/2006 |
Data da última atualização: |
13/04/2015 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
BARBOSA, G. da S.; DUTRA, R. de C.; LIMA, P. C. F.; NASCIMENTO JÚNIOR, I. C. do; BELCHIOR, P. R. M. |
Afiliação: |
G r a z i e l a d a S il v a B a r bo sa, UPE; Ricardo de Castro Dutra, Engenheiro Florestal; Paulo Cesar Fernandes Lima, CPATSA; Ives Campos do Nascimento Júnior, Engenheiro Florestal; Paulo Roberto Mendes Belchio, Chesf. |
Título: |
Estrutura da vegetação de caatinga na área de reserva legal do Projeto Caraíbas (Fulgêncio)-UHE Itaparica/CHESF, município de Santa Maria da Boa Vista. |
Ano de publicação: |
2006 |
Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 29., 2006, Mossoró. Diversidade, conservação e uso sustentável da flora nordestina: resumos. Mossoró: UFRN, 2006. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Conhecer, diagnosticar a estrutura remanescente da vegetação de caatinga na área de reserva legal do Projeto Caraíbas (Fulgêncio)-UHE Itaparica, foi realizado um estudo de composição florística e fitossociológica. |
Palavras-Chave: |
Composição florística; Fitossociologia; Pernambuco; Santa Maria da Boa Vista. |
Thesagro: |
Caatinga; Recurso natural. |
Thesaurus Nal: |
Vegetation. |
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CPATSA/33874/1/OPB689.pdf
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Marc: |
LEADER 01109nam a2200241 a 4500 001 1157502 005 2015-04-13 008 2006 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aBARBOSA, G. da S. 245 $aEstrutura da vegetação de caatinga na área de reserva legal do Projeto Caraíbas (Fulgêncio)-UHE Itaparica/CHESF, município de Santa Maria da Boa Vista. 260 $aIn: REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 29., 2006, Mossoró. Diversidade, conservação e uso sustentável da flora nordestina: resumos. Mossoró: UFRN$c2006 520 $aConhecer, diagnosticar a estrutura remanescente da vegetação de caatinga na área de reserva legal do Projeto Caraíbas (Fulgêncio)-UHE Itaparica, foi realizado um estudo de composição florística e fitossociológica. 650 $aVegetation 650 $aCaatinga 650 $aRecurso natural 653 $aComposição florística 653 $aFitossociologia 653 $aPernambuco 653 $aSanta Maria da Boa Vista 700 1 $aDUTRA, R. de C. 700 1 $aLIMA, P. C. F. 700 1 $aNASCIMENTO JÚNIOR, I. C. do 700 1 $aBELCHIOR, P. R. M.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
07/12/2016 |
Data da última atualização: |
06/02/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
UTSUNOMIYA, A. T. H.; SANTOS, D. J. A.; BOISON, S. A.; UTSUNOMIYA, Y. T.; MILANESI, M.; BICKHART, D. M.; AJMONE-MARSAN, P.; SOLKNER, J.; GARCIA, J. F.; FONSECA, R. da; SILVA, M. V. G. B. |
Afiliação: |
Adam T. H. Utsunomiya, UNESP; Daniel J. A. Santos, UNESP; Solomon A. Boison, Nofima, Ås, Norway; Yuri T. Utsunomiya, UNESP; Marco Milanesi, UNESP; Derek M. Bickhart, ARS, USDA, Beltsville; Paolo Ajmone-Marsan, Università Cattolica del Sacro Cuore, Piacenza, Italy; Johann Sölkner, BOKU - University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna, Austria; José F. Garcia, UNESP / IAEA; Ricardo da Fonseca, UNESP; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL. |
Título: |
Revealing misassembled segments in the bovine reference genome by high resolution linkage disequilibrium scan. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 17, article 705, 2016. |
DOI: |
https://doi.org/10.1186/s12864-016-3049-8 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Background- Misassembly signatures, created by shuffling the order of sequences while assembling a genome, can be detected by the unexpected behavior of marker linkage disequilibrium (LD) decay. We developed a heuristic process to identify misassembly signatures, applied it to the bovine reference genome assembly (UMDv3.1) and presented the consequences of misassemblies in two case studies. Results -We identified 2,906 single nucleotide polymorphism (SNP) markers presenting unexpected LD decay behavior in 626 putative misassembled contigs, which comprised less than 1 % of the whole genome. Although this represents a small fraction of the reference sequence, these poorly assembled segments can lead to severe implications to local genome context. For instance, we showed that one of the misassembled regions mapped to the POLL locus, which affected the annotation of positional candidate genes in a GWAS case study for polledness in Nellore (Bos indicus beef cattle). Additionally, we found that poorly performing markers in imputation mapped to putative misassembled regions, and that correction of marker positions based on LD was capable to recover imputation accuracy. Conclusions - This heuristic approach can be useful to cross validate reference assemblies and to filter out markers located at low confidence genomic regions before conducting downstream analyses. |
Palavras-Chave: |
GWAS; Imputation; Misassembly. |
Thesagro: |
Bos Indicus; Bos Taurus. |
Thesaurus NAL: |
Genome; linkage disequilibrium. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
Marc: |
LEADER 02353naa a2200337 a 4500 001 2058210 005 2024-02-06 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1186/s12864-016-3049-8$2DOI 100 1 $aUTSUNOMIYA, A. T. H. 245 $aRevealing misassembled segments in the bovine reference genome by high resolution linkage disequilibrium scan.$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aBackground- Misassembly signatures, created by shuffling the order of sequences while assembling a genome, can be detected by the unexpected behavior of marker linkage disequilibrium (LD) decay. We developed a heuristic process to identify misassembly signatures, applied it to the bovine reference genome assembly (UMDv3.1) and presented the consequences of misassemblies in two case studies. Results -We identified 2,906 single nucleotide polymorphism (SNP) markers presenting unexpected LD decay behavior in 626 putative misassembled contigs, which comprised less than 1 % of the whole genome. Although this represents a small fraction of the reference sequence, these poorly assembled segments can lead to severe implications to local genome context. For instance, we showed that one of the misassembled regions mapped to the POLL locus, which affected the annotation of positional candidate genes in a GWAS case study for polledness in Nellore (Bos indicus beef cattle). Additionally, we found that poorly performing markers in imputation mapped to putative misassembled regions, and that correction of marker positions based on LD was capable to recover imputation accuracy. Conclusions - This heuristic approach can be useful to cross validate reference assemblies and to filter out markers located at low confidence genomic regions before conducting downstream analyses. 650 $aGenome 650 $alinkage disequilibrium 650 $aBos Indicus 650 $aBos Taurus 653 $aGWAS 653 $aImputation 653 $aMisassembly 700 1 $aSANTOS, D. J. A. 700 1 $aBOISON, S. A. 700 1 $aUTSUNOMIYA, Y. T. 700 1 $aMILANESI, M. 700 1 $aBICKHART, D. M. 700 1 $aAJMONE-MARSAN, P. 700 1 $aSOLKNER, J. 700 1 $aGARCIA, J. F. 700 1 $aFONSECA, R. da 700 1 $aSILVA, M. V. G. B. 773 $tBMC Genomics$gv. 17, article 705, 2016.
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